電気自動車やハイブリッド車など環境性能の高い次世代自動車・・・軽自動車1000円、普通車2000円、トラック5000円とする案を軸に検討しているが、環境への影響が比較的小さいエコカーを軽自動車扱いする方針

記事中にあるように「エコカーとその他の普通車を瞬時に判別する」のは難しいでしょうね。i-MiEVやステラはもともと軽規格です。
充電施設が地方のサービスエリアなどに設置されていない段階で,電気自動車で遠出をする人はまず,いないでしょう。